12年前，在利姆加尔德王国发生的事件留下了大谜团，正从人们的记忆中被忘却。时光流逝，尤伊和蕾娜两姐妹在艾纳斯特利亚皇国过着平稳地日常生活。在那样的一天，一个巨大的机体向艾纳斯特利亚袭来。以这天为界，少女们被卷进了命运的漩涡之中。

在码头战斗后的第二天，还是无法触及事件的真相，尤伊作为艾纳斯特利亚女皇回应记者招待会。强势的行为、蕾娜的宣告、利姆加尔德的关联和这次事件的真相令尤伊感到困惑。被雷兹鼓励后尤伊恢复了精神，但在那样的尤伊面前，名为英格丽德的谜之女性出现了。

阿勒克图眼看击退了敌方的雷加利亚·基尔。但是蕾娜突然发生了异变，整个人失去知觉。于是约翰对阿勒克图施加追击。此中提西斯出现，对阿勒克图进行斩击。蕾娜好不容易恢复意识，提西斯眼看事情了结便安然离去。事件后的第二天，在街上忙着祭典的准备的尤伊和蕾娜，与萨拉和蒂亚相遇。

两次事件以后，尤伊她们继续进行着调查。在临近建国记念日的某天，利姆加尔德王国的侍从武官亚伯来访问尤伊和蕾娜。“蕾娜大人就交给我吧”亚伯发出提案，但尤伊坚决不肯把蕾娜交出来，然而亚伯质问尤伊是否有足够的觉悟。

面对自己的弱点，尤伊和蕾娜注意到了大家的支持。两人决定与亚伯再次见面，制定一个计划。尤伊一边自己烦恼着，一边作为艾纳斯特利亚皇国女皇寻找自己应有的状态。然后在建国纪念日当天，下定决心的尤伊和蕾娜与亚伯再次对峙。