名门贵族北镰仓的法门寺家出身神秘，代代不问政治、专心致力于学问，对犯罪学有深入研究，而且，家里的长男代代遗传IQ246的高智商，法门寺家的第89代当主法门寺沙罗驱也不例外。身为IQ高达246的天才，沙罗驱在凡人治理的当代世界中无所事事，便经常在闲暇时解决自己认为值得解开的谜题。这天，警视厅的刑警和藤奏子突然被分配到搜查一科。而上司交给她的任务不是什么恶性案件，而是去给法门寺家的当主做护卫。奏子不明白守卫东京治安的刑警为何要给沙罗驱当保镖。而且，据说被分配当护卫的人都会在一个月内辞职。带着各种疑问，奏子来到法门寺家。出来迎接她的是法门寺家的管家贤正。出身草根的奏子对于沙罗驱有管家一事感到惊奇。闲得无聊的沙罗驱偷偷从家里跑出去，偶然到了某案件的案发现场。只看了女性被害者一眼，沙罗驱就说出了被害者的品行和犯人的杀人手法。但是，他因为没钱付出租车的车费而被带到警局。因为法门寺家的存在是国家机密，所以警视总监一声令下，沙罗驱立刻恢复自由身。另一方面，贤正和奏子听说沙罗驱被捕后赶到警视厅。沙罗驱与奏子第一次见面就准确说出了她的生活水平和心情。这时，怪才法医森本朋美对遗体进行检查后得到了初步结论，当听说沙罗驱的观点与她相同时，朋美为能见到沙罗驱而欢喜雀跃。回到府邸后，法罗驱接见了大财主樱庭家的夫人。为樱庭家工作且住在她家的寿司师傅宫岛失踪了，樱庭夫人想请沙罗驱帮忙寻找宫岛。沙罗驱不太情愿地开始打探案情。看到宫岛常用的菜刀和磨刀石时，沙罗驱眼前一亮，态度大变，积极调查起来。在樱庭家的宴会上，沙罗驱认识了宴会的主宾、广告策划早乙女。宴会正在进行时，早乙女的手机响了。听说公司进了强盗而且有部下被杀后，早乙女连忙赶回公司。不知何故，沙罗驱也跟了出去。

一段时间以来，连续发生了与在年轻人中流行的漫画《Kill list》相似的自杀案件。《Kill list》讲的是把法律无法制裁的坏人的名字写入清单，然后由恶魔施法让坏人自己了断的故事。在网上关于能不能接受私下制裁做过坏事的人、杀人清单是否真的存在的讨论已经成为了热门话题。听说这些流言的沙罗驱断言“恶魔不可能被逼自杀。明明是杀人。”这时，警方找到了都内发生的三起“Kill list”案件的被害者的共同点。他们都曾是虐待儿童至死的嫌疑人。虽然警察从死状断定他们是自杀，但对三人之死颇感兴趣的沙罗驱不顾奏子的阻止，和管家贤正一起展开了调查。通过三个死者的共同点顺藤摸瓜的沙罗驱发现了一个关键人物——补习班讲师前川公平。前川是个可以任由学生给自己起外号的开朗的人。但是，实际上，十年前他有过幼妹被杀害的不幸经历。

沙罗驱和贤正去足底按摩店接小瞳和奏子，碰上了贤正的高中同学泷乃川美晴。美晴最近作为主妇模特大为活跃，她的丈夫是能干的地产公司社长，世上的女性无不羡慕她的生活。贤正和美晴许久不见，感慨颇多，非常高兴。为了再见面，他们交换了联系方式。然而，数天之后的一个晚上，美晴的丈夫隆文在自家书房遇害。犯人是与隆文有金钱纠纷的工厂经营者下村辰也，不知为何下村头破血流也死在隆文身边。根据第一发现者晴美的证言和现场证据，警方认为此案是对隆文怀恨在心的下村侵入泷乃川家，刺死隆文，而后被正巧倒下来的花瓶击中头部身亡。贤正陪在突遭不幸的美晴身边。但是，沙罗驱却对美晴不可思议的言行心生怀疑。与他相反，贤正十分维护美晴。围绕着美晴的事，沙罗驱和贤正产生了分歧。

这天，在都内某50层的高级公寓最顶层的房间中，大学医院外科综合部长土门贤治被发现死于非命。凶器是土门房间中的装饰品和水果刀。从现场情况看，土门是在读书时出其不意被人从背后打击头部，然后用水果刀两度刺中背部。土门的妻子半年前去世，他没有孩子，独自一人生活。警方根据土门家中有财物被盗判断这是一起强盗杀人案。但是，在案发时间，公寓的十几台防盗窃摄影机都没有拍到可疑人物。通往土门家的电梯由电脑控制，必须有密码才能到达50层。媒体大肆宣扬这是一起“天空密室杀人案”。嗅到奇案的“味道”的沙罗驱带着贤正、奏子溜到案发现场。他检视了现场尸体上的眼镜和水果盘里的葡萄柚，还注意到排列爵士乐CD的书架上有一枚未开封的古典乐CD。根据这些物证，沙罗驱推断这是一起伪装成强盗杀人的谋杀案，认为追查对死者有仇恨的人可以找到犯人。他凭着仅有的几条线索，打听到了土门屋中唯一的古典乐CD的演奏者、女钢琴家二本松由里的事。

受上代管家贤丈之托，沙罗驱、奏子、贤正参加某画廊的开业晚会。在晚会上，他们认识了在仪式上进行表演的新锐歌手千代能光一。千代能从学生时代起就与好朋友番田一起结成了“香蕉&巧克力”组合。融合了二人才能并加入最先进技术的崭新的艺术形式大受欢迎，他们十分活跃，甚至进入了奥运会开幕式表演嘉宾的候选名单。在会场上，头戴耳机的客人们体验了“香蕉&巧克力”推出的采用最新技术的AR。一群人或是向空中伸出双手想要抓住什么，或是失去平衡，场面盛况空间。这时，豪华的开幕式开始了。千代能进行欢迎致辞，客人们欢声雷动。就在此时，头戴耳机的番田在会场的楼上登场。他先是做出像舞蹈一样的让人不可理解的动作， 然后就失足坠落，死在了沙罗驱等客人面前。重要伙伴番田的意外身亡让千代能备受打击。而看了现场检验后，沙罗驱对番田摔落事件颇有兴趣，于是到千代能的事务所拜访。