布鲁斯经历了生死考验后，像是想通了一切。既然邪恶会一直存在，正义难以在光明底下对邪恶进行制裁，那么他便化身成为黑夜里的英雄，守护哥谭市。布鲁斯穿上自制的蒙面黑衣，开始在黑夜中穿梭在大街小巷，以自己的方式制裁犯罪份子。他来到后巷，把两名正在打劫市民的暴徒打倒在地时，暴徒却义正言辞地摸出一张违法执照，以示自己身份。无独有偶，一群暴徒闯入一对新人的婚礼现场进行打劫。企鹅的手下维克多·萨斯正在现场，他看见劫匪后，便出言质疑他们的行动，但看见劫匪们摸出违法执照后，萨斯立即一转态度，让劫匪们好好享受打劫的乐趣。企鹅即使失去了哥谭市长之位，但在哥谭的影响力依旧还在。他一手创立的违法执照制度，让很多暴徒都“拿了牌”犯罪，这虽然助长邪恶风气，但哥谭的暴力犯罪率却降到了前所未有的低度。黑白两道对企鹅的做法都非常服气，但依旧有人，想推翻他的恶行。除了布鲁斯以外，戈登也对此深通恶绝。在一个美好的早晨，戈登正在去熟悉的咖啡店买咖啡，却发现老板正被一名拿着执照的劫匪打劫。戈登看见执照后不屑一顾，出手把歹徒制服后，并带回哥谭警局制造恐惧液的克兰虽然死了，但恐惧液的威力引来很多不法之徒的垂青。克兰的儿子乔纳森被注射毒液后，因为产生幻觉，对社会造成危害，被关进了阿卡姆疯人院。一群凶徒为了利用恐惧液为非作歹，于是贿赂了典狱长，把乔纳森放出来，让他把克兰生前的配方从旧房子中挖了出来。歹徒们利用毒液对人产生的恐惧感，打劫了银行，并让银行职员、客户们的精神崩溃了。戈登和哈维通过抽丝剥茧，总算在疯人院典狱长的口中，问出了凶徒的名字——格雷迪·哈里斯和默顿。塔比莎失去芭芭拉后，便和塞琳娜相依为命。企鹅的俱乐部准备开张了，萨斯找到她们的住处，要她们参加开张晚宴，对企鹅俯首称臣。要么低头，要么死，深谙哥谭生存之道的塞琳娜似乎对此并不抗拒，但塔比莎却不想。戈登正为违法执照之事而焦头烂额时，布鲁斯无声无息地出现在他身后。说起违法执照时，两人交换了信息，并对此表示无奈。然而，两人心中都有一团火，都不想让企鹅在哥谭横行无忌。戈登从布鲁斯的话中得到了启发，可以挑衅企鹅，借他的手去铲除哈里斯。然而，当他组织行动组时，同僚们不仅不买他的账，还对他拳打脚踢，以惩戒他的多管闲事。

乔纳森克服对稻草人的恐惧后，便感觉世上再无东西可以让他害怕。他穿上稻草人的衣服回到阿卡姆精神病院，利用恐惧毒素，让院长陷入幻觉，让院长不断看见最害怕的小丑，从而丧失理智。乔纳森掌握了阿卡姆的控制权，他大肆释放毒素，让病院里的人都陷入疯狂，一夜之间，阿卡姆病院的病人都成为了乔纳森的军队。布鲁斯在夜里干了几票替天行道的事儿后，便有点得意忘形，终于碰了钉子。他在跟踪劫匪时不小心从屋顶摔下，被人当作是闯入者，被押到警察局。尽管布鲁斯很快便被阿尔弗雷德请来的律师保释走了，戈登也清楚布鲁斯的为人表示不会追究，但这件事，让阿尔弗雷德显得既担心又失望。他认为少爷太狂妄了，不能让他胡来。离开警察局时，两人偶遇福克斯。福克斯关切地问起布鲁斯身上的伤，阿尔弗雷德和布鲁斯连忙谎称自己是攀岩撞到的。福克斯看着布鲁斯离开的背影，露出意味深长的眼神。塞琳娜和塔比莎不约而同地收到了一封邀请函，在夜里来到了一座塔的门前。两人一起进入塔中，都被邀请者震惊到了。塔比莎难以置信地看着眼前活生生的芭芭拉，她明明亲眼看着芭芭拉死掉了，为何她现在还生龙活虎地在哥谭出现。更让人惊讶的是，芭芭拉不仅活着，还密谋重登哥谭之巅。她展示了自己收藏的军火，以此显示自己的实力，希望塔比莎和塞琳娜能够和她合作，一起在哥谭占有一席之地。塔比莎恨透了芭芭拉，她不想再与芭芭拉狼狈为奸，但塞琳娜心动了，因为芭芭拉跟她很像，两人心中都有一团火，希望不再被哥谭的各种男人头目小看。阿卡姆陷入混乱后，戈登想出动行动队去阿卡姆压制暴动。然而，哥谭警署的警察们都认为应该由企鹅去处理这事，甚至哈维都不愿跟戈登出动，他怕自己出事的话，警局里的人就换成企鹅安插进来的人，到时哥谭警局就变成企鹅的警局了。戈登无奈地只好单独行动。乔纳森看见戈登独自前来，心里乐开了花。戈登寡不敌众，很快便落入了乔纳森的圈套，中了恐惧毒素。幻觉中，戈登看见了小莱，乔纳森则在一旁诱导戈登自杀，去追随死掉的小莱。就在戈登准备割开自己手腕时，他忽然克服了恐惧，恢复了理智，转身便对着乔纳森还击。布鲁斯再次不听阿尔弗雷德的劝，出去替天行道，并再次栽了跟斗。幸好阿尔弗雷德知道少爷的性格，再后面跟着，不然布鲁斯又会陷入危险。就在两主仆互相争吵时，福克斯突然带着一大袋东西深夜造访。原来，他制造了一身装备，方便布鲁斯“攀岩”使用。布鲁斯带着福克斯做的攀墙服，在哥谭市内飞檐走壁，锻炼自己。

布鲁斯穿上福克斯给他的特制服装，继续在深夜的哥谭行侠仗义。阿尔弗雷德见识了布鲁斯的胆识后，便也不像之前那么抗拒布鲁斯出动了，而是跟在他身边，为他保驾护航。这天深夜，布鲁斯来到码头，正暗中监视企鹅旗下的军火组织的一举一动。突然间，他看见一位小贼正在鬼鬼祟祟地潜入码头，看样子似乎想对这批军火图谋不轨。阿尔弗雷德知道情况后，认为贼偷贼，便让他们自行厮杀，想劝布鲁斯坐山观虎斗。但布鲁斯看着小贼的身影，似乎有点按捺不住，他没等阿尔弗雷德劝住便跳了下地，不料被军火队伍发现，立即展开了一场激烈的枪战。幸好布鲁斯身手了得，没有被人擒住，小贼也趁着混乱逃到了一边。小贼躲到远处后，不禁摘下面具大口喘气，原来这位小贼正是塞琳娜。企鹅科波特在哥谭市内四处安插眼线，黑白两道通吃，任何事都瞒不过他的法眼。在他彷如只手遮天的日子里，依旧有人在他眼皮底下作乱。被他冰封起来放在酒吧作摆设的谜语人爱德华，居然被人救走了。救走爱德华的人是他的小学同学兼顶级崇拜者默特尔。爱德华虽然摆脱了冰封的禁锢，但却高兴不起来，因为他跌进了另一个囚笼之中，就是遭受默特尔“爱”的禁锢。布鲁斯为了追查企鹅的军火组织，继续深入码头调查。他籍着自己小孩子的身份，混入码头区域，但是却被精明的船夫们看穿了他的来意。就在布鲁斯被人带到船长那里问话时，阿尔弗雷德 出现了。他三两下手把水手们打倒后，边带走布鲁斯，边奚落他的演技。阿尔弗雷德不再对布鲁斯说“不”，而是告诉他，要演戏，就得演该演的角色。布鲁斯的最佳角色，就是哥谭市富有，充满权力的少爷。猫头鹰法庭的真正头目、拥有不死之身的雷宵·奥古，找到了芭芭拉，委托她作为代理人，在拍卖会上把自己的古刀买下来。没想到布鲁斯知道这个消息后，也参与了竞拍。布鲁斯作为哥谭的首富，财力是芭芭拉远远不及的，他以二百万的价钱把古刀买了下来，让芭芭拉恨得牙痒痒。

布鲁斯把拍卖得来的古刀，带去给博物馆馆长温斯洛普博士进行鉴定，并拜托他帮忙研究一下，这把属于一世纪美索不达米亚国王巴拉西的古刀，到底有什么含义，蕴含什么力量。温斯洛普博士拿到古刀后，一时之间也无法判断，布鲁斯只好先把古刀放在博物馆，让博士慢慢研究一下。这时，博士那酷爱考古的孙子艾利克斯放学回来，他颇有兴致地和爷爷一起研究古刀，并礼貌地向布鲁斯打了招呼。布鲁斯和阿尔弗雷德前脚刚走，一名不速之客便闯入了博物馆。来者正是雷霄·奥古，在逼迫温斯洛普博士交出古刀未果之后，便以迅雷不及掩耳之势拧断了博士的脖子。博士在奥古闯入时，便察觉这把古刀来历不凡，让艾利克斯赶紧把古刀带走躲起来。艾利克斯躲在暗处，逃过了一劫，但爷爷就在自己面前被人杀死，这给他那幼小的心灵造成了很大的伤害。艾利克斯逃走时拉动了警报，温斯洛普博士的尸体很快便被警方发现了。戈登和同事们正在现场调查，正巧碰上前来等鉴定结果的布鲁斯。布鲁斯十分自责，如果不是他把刀子带来给博士，博士便不会死亡，凶手的身份在他心中呼之欲出，但他不方便告诉戈登。与此同时，布鲁斯最近奇怪的行迹引起了戈登的怀疑，戈登感到布鲁斯藏了很多秘密，包括这次的案件。两人谈话间，布鲁斯提及艾利克斯，他们便猜测刀子可能被艾利克斯带走了。艾利克斯没有求助警方，拿必然是带着刀子躲了起来。布鲁斯回忆了艾利克斯说的话，推测出他躲了在哥谭图书馆，温斯洛普博士专属的办公室。戈登早前因为不爽哥谭被企鹅人科波特掌控，而找到前哥谭黑帮老大法尔科内。法尔科内此时身怀绝症，正在郊外休养，无意再争天下。戈登虽然没有获得法尔科内的帮助，但结识了他那美丽的女儿索菲娅，两人很快便坠入爱河。没想到索菲娅不像戈登想的那样单纯，她体内流着法尔科内的血液，内心一直有重回哥谭掌权的念头。消息灵通的企鹅很快便约到索菲娅见面，想与她谈合作。没想到这只是一个圈套，企鹅实质想接索菲娅之手引出法尔科内的旧将们，然后把他们一举歼灭。布鲁斯和戈登在图书馆找到了艾利克斯，艾利克斯便把那晚的事告诉了戈登。没说几句，奥古派来的杀人们便找到了图书馆。经历了一番激战后，布鲁斯和艾利克斯带着古刀逃掉了。戈登命警队把奥古搜刮出来，不料，雷霄·奥古自行出现在警局，以为古刀在警局，于是借用南峰国文物领事馆馆长的身份，一脸无辜地与戈登见面，让他把属于南峰国的文物古刀还给自己。戈登知道他一肚子坏主意，于是将计就计，故意套他的话。不料，阿尔弗雷德来势汹汹地闯入警局寻人，谈话间说起失踪的布鲁斯，奥古一听，便知道古刀不在此处，立即逃走去追踪布鲁斯和艾利克斯。法尔科内在哥谭的残党们遭到企鹅科波特的毒手，让索菲娅先输了一局。然而索菲娅并未就此消沉，她知道戈登的能力和他对企鹅人的态度，劝戈登和自己以情侣档的身份，一起重掌哥谭势力。奥古的杀手们很快便跟踪到布鲁斯和艾利克斯，就在两人命悬一线之时，戈登出现了。戈登和布鲁斯联手扭转乾坤，但艾利克斯依旧被阴险的奥古挟持住，并割了他的脖子。布鲁斯内疚不已，博士是他害死的，艾利克斯也是他害死的。仇恨和愧疚占据了他的心。

布奇自从中枪后，便一直陷入昏迷。哥谭的医院跟城市一样黑暗，一些无亲无故又感觉治不好的病人，便会被安排“转院”，实质上是找个奇怪的地方，把这人埋掉。不幸的布奇在昏迷时成为这其中的一员，被失职的医护人员当作乐子一样，送到了郊区的一处死水潭那里作丢弃处理。然而，布奇却因祸得福，水潭被印第安山残余的物质污染了，布奇获得了重生，失去的手臂也回来了。而唯一不足的是，布奇失去了记忆。企鹅人掌控着哥谭大局，索菲娅顶着法尔科内的姓氏，也动摇不了他的地位。但这位年轻的黑帮大小姐并不打算放弃，她亲自找上门，以自己的家族姓氏作为条件，希望让科波特和自己合作。她提醒科波特，他现在的权力并不稳固，因为他不像法尔科内这样历史悠长的黑帮家族，很多罪犯表面上顺从，实质内心还是不服。企鹅人接受了索菲娅的邀请，去和她共进晚餐，让黑帮组织都知道科波特现在有了法尔科内家族的人撑腰。然而，这只是索菲娅计划的开始。她不仅要科波特和她合作，还要科波特发自内心地信任自己。索菲娅知道科波特和妈妈的关系十分好，于是研究了他妈妈的菜谱，在饭桌上做出了一道与他妈妈手艺一模一样的炖肉。科波特吃了炖肉后，脸上的表情便让索菲娅知道她成功了。在科波特回去后，索菲娅面对他的质疑，依旧摆出一副温柔的姿态。在看见科波特的腿不舒服时，还亲自为他按摩，并聊天谈心，说起很多关于妈妈的往事。科波特终于滑下了感动的泪水，索菲娅微笑着为科波特揉腿，内心正盘算着什么。布鲁斯一直为艾利克斯的死感到愧疚，他决定去黑门监狱找奥古报仇。布鲁斯通过查阅资料，发现这把古刀说不定不是奥古的武器，而是可以杀死奥古的凶器。阿尔弗雷德猜出了少爷的心思，想出言阻挠，但布鲁斯已经不与往日而言，不再是那个躲在管家身后的乖宝宝了。阿尔弗雷德发现时，布鲁斯已经离开了，他只好来到哥谭警局，找戈登帮忙。奥古的手下早已把黑门监狱的警卫们都换走了，布鲁斯找到他时，没过几招便被他打倒在地，随后被拖进了黑门监狱的地下室。阿尔弗雷德和戈登来到黑门监狱找人，没过多久便发现事有蹊跷。两人立即手起刀落地把假警卫们都干掉，而对黑门监狱了如指掌的戈登立即想到了地下室，两人二话不说便往那儿赶去。布鲁斯猜对了，古刀是用来杀奥古的，但这也是奥古的意愿。奥古获得了不死的诅咒，虽然能让他获得永生，但也让他经历了太多的痛苦。在半生半死时，他看见布鲁斯，认定了布鲁斯就是杀死自己，帮自己解开魔咒的人。一向行侠仗义的布鲁斯，希望坚持和阿尔弗雷德的约定，不能杀人，但奥古却威胁他，如果不下手的话，他会一直缠绕布鲁斯的一生，杀死所有他所爱的人，让他痛苦一辈子。布鲁斯想起父母，想起艾利克斯，终于忍不住，一刀刺进奥古的胸口，让他解脱了。戈登和阿尔弗雷德赶来时，布鲁斯已经杀人了。但这次情况不同，戈登和管家都没有怪布鲁斯，反而是布鲁斯陷入了自责当中。