戈登因为行为不当被踢出了警队，目前成为了哥谭市的一名赏金猎人。一天夜里，戈登在大街上走着，突然遇到一只背上张刺的彪形大汉，正在袭击一家药店。戈登闻到了金钱的味道，二话不说立即出手。虽然戈登在体型和力量方面稍逊一筹，但彪形怪人没什么脑筋，光顾着攻击戈登，没注意到从旁驶来的大卡车，出其不意地被撞到在地。新的一笔酬金又到了戈登手上。菲什带领了一帮怪人从阿卡姆的实验室逃走后，打算重整旗鼓后再夺哥谭之巅。好不容易在哥谭建立了自己势力的企鹅人科波特对菲什十分痛恨，但菲什的生命力比他想象中的更加顽强，科波特不得不采取非常手段去除掉她。芭芭拉和塔比沙目前经营着一家高级餐厅，但这只是表象。她们现在经营着黑道生意，并接一些暗杀业务，科波特就此和芭芭拉搭上了话。芭芭拉知道科波特目前在哥谭的地位非常高，衡量利弊后，她决定跟科波特交个朋友，卖他一个人情。两位性格怪异的哥谭狂徒惺惺相惜，科波特拜托芭芭拉帮他找到菲什，无论死还是活。哥谭城内多处药店出现了被怪人袭击的现象，警局顺藤摸瓜，查到了一些端倪。这些怪人都在找一种药，这种药是可以克制雨果在菲什身上做实验的变异后遗症，也说明了，就是菲什组织大批怪人，在寻找这种药。瓦莱丽是一名出色的记者，也是一名为了新闻可以不择手段的人。她为了挖掘哥谭的丑闻，故意接近戈登。无论她对戈登的好是真是假，她都成功吸引到戈登的注意了。毕竟戈登刚刚失恋，他的前度女友汤普金斯医生离开他以后，结交了新的男友，准备嫁做人妇了。瓦莱丽跟戈登交易，她手上有菲什的情报，但要求戈登向她透露警方的行动信息，以便自己能获取警方大战怪人的一手资料。戈登不知是受不住抓捕菲什的诱惑还是瓦莱丽的诱惑，他同意了。科波特如今势头大好，但是他的好朋友谜语人尼格玛还被关在阿卡姆。当时，性格孤僻的科波特被人差点弄死，是尼格玛救了他。在科波特最难过的时候，只有尼格玛陪他说话。对待友情异常耿直的科波特把尼格玛视为知己，他决定要把这个好朋友从阿卡姆救出来。戈登在一处制药厂找到菲什，两人进行了一番激战，但依旧让菲什溜走了。布鲁斯·韦恩被雨果捉到印第安山时差点没命，事后他离开了哥谭一段时间，为了安全，也为了特训。印第安山是韦恩家族的产业，但自己却差点在自己的地方殒命。布鲁斯觉得这一切都事有蹊跷，这次他回到哥谭，决定把插手自己家业的老鼠揪出来。菲什现在的身体状况越来越糟糕，她于是抓到雨果的助手埃塞尔，打算让她修复自己。但埃塞尔表示，自己也无能为力。菲什在牢里没少受埃塞尔的“招待”，如今这个女人对自己已经毫无用处了，菲什挥一挥手，手下便让埃塞尔去了见上帝。赛琳娜此时在菲什身边做小跟班，她目睹着这一切的发生，早已见怪不怪。就在赛琳娜以为今天的混乱要结束时，她的好朋友艾薇却被人捉到菲什面前。菲什认为，这个女孩是敌方势力派来的探子，但艾薇只是好奇赛琳娜这几天不知道去哪了，才跟踪至此。无论艾薇出于任何目的，她知道的东西太多了，菲什不能留她，只好命人对她痛下杀手。艾薇趁人不备时立即逃走，随后遭到追捕，赛琳娜也紧随其后，希望能制止这场误会。艾薇不胜脚力，被人追上了，一不留神便失足掉进了一个水渠。赛琳娜冲上前一看，艾薇已不见踪影。

布鲁斯·韦恩逐渐成长，对待那些想要祸害自己集团的人，态度也开始强硬起来。雨果教授在印第安山时进行的非法实验，实际上是受到一个神秘组织在背后操控。布鲁斯发现，这个组织就潜伏在自己的集团内，对自己的家业造成巨大的威胁。布鲁斯那种超出年纪的冷静果断，在集团会议上给其他人带来了一定的震慑力，也引起了神秘组织的戒心。布鲁斯被神秘组织掳走了，阿尔弗雷德寡不敌众也被打倒受了伤。布鲁斯被带到一处大宅里，一个戴着面具的女人正对着他微笑。布鲁斯知道这人不怀好意，因此一改自己的绅士教养，直接开门见山与她谈起条件。这个女人叫凯瑟琳，她摘下面具时，布鲁斯对她的脸有印象，因为他在好几次的集团、家族活动上都见过她。布鲁斯细思极恐，这些邪恶的事业一直在韦恩集团里潜伏着，而自己却毫不知情。凯瑟琳以布鲁斯身边之人的安危作为交换条件，逼他停止对组织的调查，并交出集团的实权。对于布鲁斯来说，家人、朋友就是他的软肋，无奈之下，他只好就范。艾薇掉进下水道后，发生了怪事。受了伤的她，被路过的男人救了，随后，她发现自己的身体产生了变化。艾薇从一个毛丫头，突变为一个成熟的、身材极好的美貌女子。这种转变虽然十分诡异，但艾薇却觉得这是她人生的转机。艾薇不仅身体产生了变化，她还获得了操控植物的能力。菲什和一批怪人早前被哥谭警局围剿过，但警力不足，菲什等人再一次从警方手中溜走了逃脱了。企鹅人就这件事借题发挥，因为他之前成功把菲什从哥谭赶走，他认为政府、警方都是无能的，自己才是哥谭之王，自己才有能力保护哥谭。企鹅人的当众演说获得了众多市民的认可，大伙儿纷纷都把他当成哥谭的新英雄，是大家的领袖。菲什来到囚禁雨果的监狱，想向他拿解药，治好自己的身体问题。布洛克带领警方围剿菲什时，被菲什反擒。戈登为了救布洛克，亲自上门跟菲什交涉，他知道，菲什只是想要药，还有脱身的机会。但现在雨果表示他无法一下子交出解药，他需要时间。企鹅人带了一大群人来参与这场骚动，他想借此机会向大伙儿证明，哥谭警方的无能，只有自己才能救哥谭。戈登为了救布洛克，与菲什达成了交易，就是让她和雨果趁乱从后门的树林逃走，菲什便答应放过布洛克。但戈登不打算放虎归山，他也知道企鹅人的实力，于是给企鹅人通风报信，让他在树林处守着，随时对菲什进行伏击。菲什按照原定的计划准备逃脱，但企鹅人早就已经在树林等着了。企鹅人再次见到菲什，随即把心中的愤怒宣泄一番，但菲什当时在大桥下，并没有杀死他，这个谜题一直在企鹅人心中挥之不去。为什么菲什当时不杀了他，如果企鹅人在那一晚死了，那么他们现在就不会有如此的下场了。菲什此刻一改平日骄横跋扈的姿态，而且以怜爱的眼神看着企鹅人。企鹅人是菲什的作品，是她的打伞小弟。企鹅人变成现在这个样子，让她有种骄傲的感觉。企鹅人动了恻隐之心，放了菲什一马。布鲁斯平安回到家里，阿尔弗雷德总算放下心来。虽然要面对的问题很多，但布鲁斯一直在成长，阿尔弗雷德相信少爷有足够的能力应付。就在两人思考下一步计划时，家里突然出现一个男孩，这个男孩的外形跟布鲁斯一模一样。

布鲁斯让假布鲁斯暂住在家里，给他温饱。假布鲁斯不知道自己是谁，只知道菲什把自己从雨果手中救出后，便逃到哥谭。此后他一直四处流浪，直到有一天，他在赛琳娜的天台那里，看见了布鲁斯，才对自己的身份产生怀疑。阿尔弗雷德与假布鲁斯相处下来，发现他性格跟布鲁斯十分相似，格斗术十分出色，这不难想象，这个假布鲁斯，是神秘组织让雨果做的复制人，这当中可能隐藏着什么阴谋。哥谭城中出现了一名催眠魔术师——杰维斯·泰奇。他能够控制人心，让人在催眠的状态下，做出意想不到的行为。他在芭芭拉的酒吧进行了一场精彩的表演，吸引了众人的注意，一时之间，成为哥谭城中炙手可热的魔术明星。但是他的目的不只是要名和利，在他的内心，有更加黑暗的计划。杰维斯找到戈登，要求他帮忙找到自己的妹妹爱丽丝。杰维斯和妹妹父母早亡，两人相依为命。爱丽丝的血液里含有毒素，杰维斯为了治好爱丽丝，把她送到雨果教授那里，没想到，这一送就是把妹妹推进了火坑。爱丽丝在之前的一次骚动中逃脱了，目前下落不明，他出高于警局的价钱委托戈登，希望他能够帮到自己。戈登从塞琳娜口中知道爱丽丝现在打工酒吧，于是前往查探。爱丽丝在她打工和暂住的地方引起了混乱，惹来了众多仇家。戈登顺藤摸瓜，终于见到了爱丽丝。正当戈登打算制服爱丽丝时，他发现爱丽丝并不像她哥哥那般渴望兄妹团聚。爱丽丝害怕杰维斯，她恳求戈登，不要把自己的下落说出去。企鹅人科波特不仅仅要做哥谭的无冕之王，他还希望实际在哥谭获得实权，于是，他决定参与竞选市长。企鹅人先是用武力，威胁原来的市长，让他不要跟自己争夺这个位置，随后他来到阿卡姆疯人院，利用职务之便，让院长把尼格玛释放出来。他的身边，需要一个忠诚的战友。戈登觉得事有蹊跷，于是质问杰维斯到底怎么回事。原来杰维斯早就接了芭芭拉的委托，芭芭拉想要杰维斯把戈登带进地狱。就在戈登被杰维斯催眠，走到高楼的边沿时，爱丽丝突然出现，她举枪指向杰维斯，把他赶跑。戈登在吵闹中清醒过来，可惜一个不留神便失足掉了下楼，就在这千钧一发之际，爱丽丝伸手把他拉了上来。爱丽丝救了戈登，但戈登掏出手铐，把爱丽丝带回警局领赏。假布鲁斯流落街头时，无意中获得了塞琳娜施舍的金钱，而当他知道布鲁斯和塞琳娜的关系后，便对这个女孩产生了奇怪的想法。一天夜里，他从布鲁斯家里偷走了一辆劳斯莱斯，然后不辞而别。假布鲁斯找到塞琳娜，约她出去兜风。

企鹅人科波特开展了一系列的市长竞选活动，在公众面前建立了良好的形象。尼格玛被科波特从阿卡姆监狱弄出来后，便成了科波特最信任的人。两人异常投机，无论公事还是私事都非常合拍。尼格玛的突然上位，惹来了布奇的嫉妒。布奇原以为自己在科波特身边的地位很难动摇，而尼格玛的出现，让他有了巨大的危机感。戈登被杰维斯催眠过后，便经常产生幻觉。只要他听见一些钟表的“滴答”声，便会无意识地做出一些自杀行为，这对戈登的性命产生了威胁。他为了找出杰维斯，于是与芭芭拉见面，希望她能把情报告诉自己。芭芭拉见到戈登非常兴奋，随即像往常一样，对戈登调戏一番，可惜戈登并无雅致，他只想尽快找出杰维斯，解除自己的催眠状态。芭芭拉虽然疯癫狂妄，但她对戈登还是有感情的。她见戈登遇到危险了，便把杰维斯要招募打手的情报提供给他。戈登虽然没有了警方的身份，但处理怪人方面，警局里没有人比他更了得。在布洛克的帮助下，戈登进入问询室向爱丽丝问话，了解到他们兄妹的身体情况和经历。就在这时，杰维斯带着被催眠了的打手闯进警察局。打手们身材魁梧，哥谭警员们几乎都不是他们的对手。戈登掏出枪想制止杰维斯，杰维斯笑了笑，拿出怀表向着戈登。戈登的手瞬间不受控制，枪口转而对准自己的太阳穴。大伙儿制止不了杰维斯，爱丽丝被他掳走了。爱丽丝被杰维斯绑了起来。她看着哥哥拿出一个个针筒，便知道他要找到自己的真正目的并不仅仅是“兄妹团聚”，更重要的，是想利用自己的血制成武器。戈登和布洛克此时赶到，与杰维斯进行了一番较量。戈登以坚强的意志，战胜了杰维斯的催眠，但爱丽丝在混乱中，失足掉了下楼，她的身体直插在尖杆上，瞬间身亡。科波特在市长竞选中势头十分好，尼格玛对此十分欣慰。然而，尼格玛却发现，布奇在暗中塞钱给选举委员会，这让他认为此举对科波特并非有利，也让他嗅到了上位的机会。布奇发现了尼格玛私下阻止了他的舞弊行为，于是在众目睽睽之下对尼格玛动粗，尼格玛毫不畏惧。他直指布奇做的这些行为，是对科波特不信任的表现，因为科波特如今是人心所向，布奇的这些行为，反而会毁了科波特的声誉。这时，电视机传来科波特当选市长的新闻。事实胜于雄辩，尼格玛以胜者的姿态嘲讽布奇，说布奇不相信科波特能当选市长才这么做。科波特目睹了布奇这番行为，对他也失去了信任。科波特当选市长后，把尼格玛升为自己的幕僚长，布奇眼白白地看着本属于自己的职位被这个中途出现的怪人夺走，怨恨之火在心里燃起。

科波特成为了哥谭的新市长，他终于从一个穷小子站到了哥谭的顶峰。最让他遗憾的是，目前的这些辉煌，他不能跟最爱的妈妈分享。但科波特依旧希望他能让妈妈和自己一起，接受市民的欢呼和掌声，于是他把妈妈的雕像搬到市政厅门前，骄傲地向大家分享他妈妈的经历，他成长的苦涩。正当大家都沉醉在科波特动人的演说中时，“红罩头帮”突然开着卡司冲过来，并以迅雷不及掩耳之势开枪乱射。科波特并无大碍，但妈妈的雕像却被射散了。科波特最讨厌别人伤害他的妈妈，“红罩头帮”这下恐怕要吃不了兜着走了。假布鲁斯冒充布鲁斯与猫女塞琳娜约会，但被塞琳娜识破了。假布鲁斯并无恶意，且他比布鲁斯更加强势，竟然亲吻了塞琳娜。虽然不知道雨果制造假布鲁斯所为何事，但假布鲁斯十分有自知之明，他表示自己会从布鲁斯面前消失，不给他添乱。塞琳娜还在生布鲁斯的气。为了补偿塞琳娜，布鲁斯决定帮她找回她失踪的朋友艾薇，于是向戈登求助。戈登透过布洛克了解到，最近确实有艾薇的踪影在城郊那边出现，但是只留下了一些破旧的衣物，艾薇还是不之所踪。小莱被哥谭警局重新聘请，戈登再次见到他的前度女友。戈登虽然现在还是对小莱有感情，但小莱准备跟未婚夫马里奥结婚了，戈登明白人应该向前看的道理，且最近跟女记者瓦莱丽打得火热，他开始对自己的恋情有了新的态度。“红头罩帮”在哥谭四处破坏，这些破坏都是有针对性的，就是专挑宣传科波特的地方。科波特发散人手去把这群狂妄之徒揪出来，终于查出了他们的巢穴。而这群“红头罩帮”并非真正的“红头罩帮”，而是布奇特意安排的一出戏。他想先制造出一场混乱，然后自己亲手制裁红头罩帮，成为平息这场骚动的英雄，从而在科波特面前领功。可惜尼格玛早就察觉到这些蛛丝马迹。布奇被尼格玛揪到了把柄，一时之间不知所措，但尼格玛出乎意料地拉布奇入伙。尼格玛打算让布奇和自己联手，扳倒科波特。尼格玛让布奇假装成红头罩帮，然后在科波特的派对上对他进行突袭。布奇起初不想答应，但现在自己被尼格玛抓住了把柄，因此只好就范。科波特在芭芭拉的酒馆举行了热闹的派对，布鲁斯和塞琳娜也是座上客。塞琳娜在四处溜达时，有个成熟的女子突然向她打招呼，这让她有点无所适从。这个女人对塞琳娜似乎很熟悉，可是塞琳娜对她毫无印象。就在科波特向大家致词时，一个红头罩帮突然冲进来，向着科波特射了一枪。科波特想闪躲，但尼格玛拉住他。科波特吓坏了，他以为尼格玛要陷他于不义，直到他听见尼格玛调皮的笑声。尼格玛脱掉袭击者的头罩，科波特看见这人就是布奇。尼格玛原来摆了布奇一道，这下科波特对布奇彻底失去了信任，尼格玛成功成为了科波特身边最得力的战友。布鲁斯知道塞琳娜和假布鲁斯接过吻后，一直久久不能释怀。他把塞琳娜带到天台，向她委婉地诉说心中的感受，随后吻了她。塞琳娜佯装不在意的样子，其实内心非常感动。因为她得到了布鲁斯的初吻。