西非卡巴利亚首都费尔雷恩中卡友好医院内，一名高执并伴有呃逆的病人入院后迅速死去。经中国医疗队传染病专家郑书鹏进入斯宾塞实验室检测得知，病人感染的是致死率能够高达90%的埃博拉。中卡友好医院被紧急封锁，接诊十八床病人的医护被隔离，医疗队员们第一次意识到埃博拉的凶猛。

中国医疗队员们对他们是否能如期平安回国惴惴不安。而郑书鹏，则对盖斯姆的安危，以及卡巴利亚疫情的发展趋势感到忧心忡忡。国内，燕都省人民医院接收到来自医疗队的汇报，因为国家卫计委已经決定派出中国疾控中心检测队，作为传染病防治的重要力量，开始为可能发生的派造提前做准备。郑书鹏通过多个线索发现了可能的疫区一一桑宜村。记者何欢根据发小甘姆的情报，进入桑宜村进行调查。

接诊十八床病人的郑书鹏的好友盖思姆医生不治身亡，为了弥补盖思姆的遗憾，他决心前往桑宜村，为卡巴利亚的抗疫尽可能地多做点什么。燕都省人民医院接到正式通知，调员遣将组建援卡医疗队，整个医院开始紧锣密鼓地进行针对性培训和准备工作。何欢和甘姆意外撞见莫塞斯手下处理埃博拉死者尸体，被莫塞斯当成奸细想要就地处决。

郑书鹏刚进桑宜村，就见到了何欢和老同学布拉罕。布拉罕被叫出去看病，桑宜村医院只剩下郑书鹏和何欢，却不想遇上孕妇难产。桑宜村在黑石寨的势力范围内，莫塞斯带人前来威胁挑衅，无论是郑书鹏还是何欢，在莫塞斯的威胁下，都选择了首先保护产妇。

经过三天准备，中国医疗队和检测队整装出发。桑宜村隔离区顺利建成，疑似患者如数隔离，郑书鹏受邀参加村子里的新生仪式。谢云虎得到妻子的理解连夜打报告请求留在卡巴利亚。桑宜村的老酋长多日不能正常排尿，巫医和布拉罕都无能为力，焦急之时，郑书鹏用孙思邈的方法进行救治，老酋长果然好转。