星历41153.7，星际联邦第五艘命名为企业号（USS Enterprise，NCC-1701-D），同时也是最先进的星舰正式入役，首任舰长为备受尊重的让-卢克·皮卡德上校，企业号接到的第一项命令是前往新设立的远点地面站调查交易情况。然而，企业号在前往远点站的过程中被一个自称Q的超维度生命体拦了下来，指控船上的所有类人生物都还野蛮、未开化，没有资格在宇宙中历险，皮卡德和船员们要是想证明自己就必须接受挑战，调查即将发生在远点地面站的一系列神秘事件的真相。

星历41209.2，企业号奉命前往一个红巨星附近调查S.S.齐奥尔科夫斯基号失联的原因，然而当他们抵达后才发现，齐奥尔科夫斯基号上一片狼藉，像是“开过一场疯狂派对”，而船员们则全部牺牲，更为诡异的是船员们似乎是死于自杀和互殴。卡拉希尔医生检验后发现所有的症状与几十年前詹姆斯·寇克上校指挥的企业号（NCC-1701）所遇情形类似：由于红巨星的重力场使人体内的部分水分子重新组合成为酒精，造成醉酒，令船员们失去判断力，作出危害生命的举动，就连人造人数据都不例外。糟糕的是，这种情形也开始在企业号上蔓延开来，卡拉希尔医生必须尽快开发出疫苗，拯救船员……

星历41235.25，企业号前往利根II（Ligon II）进行交涉，希望获取当地一种用作疫苗的原料，然而，令人意外的是因为社会风俗，利根女性地位较低下，因此骄傲自满的利根独裁者卢坦（Lutan）此前从未见过强势的女性，而当他发现安全官塔莎是个女性后，就要求她成为自己的妻子，否则便不交付药品，另一方面，根据利根传统，塔莎必须同卢坦的第一任妻子开展决斗才能成为正室，进退两难的塔莎必须找出两全其美的办法。

星历41386.4，企业号前往追赶一艘弗瑞吉飞船，后者在γ金牛座IV（Gamma Tauri IV）偷走了一座联邦T-9型能量转换器，然而当行驶至德尔斐－阿杜星系（Delphi Ardu system）时，双方飞船都遭遇了原因不明的能量衰竭，原来是附近行星上的一个远古人工智能“63号通道”见双方发生冲突，决意给双方设下一个考验，最后瑞克以自己的智慧和宽容赢得了“63号通道”的信任，而阴险狡诈的弗瑞吉人也得到了应有的惩罚。

星历41263.1，星际舰队命令企业号与无惧号会和，接受曲速工程师科辛斯基提供的技术升级——这些升级在无惧号和埃阿斯号上运行时效果良好，然而上到威廉·瑞克，下至轮机员没有一个人信任这些升级。在测试中，意外发生了，企业号以接近曲速10级的高速飞出了银河系，直到飞过两个河外星系时才勉强刹住车，这个距离以正常速度至少要飞200年，皮卡德下令返航时，企业号飞得更快了——她超越了宇宙边界，来到意识和显示的交汇处。直到这个时候众人才发现，科辛斯基只是个会说大话的家伙，真正改造企业号的他的助手“旅行者”。