武三通亦到江南找陆家寻仇，三通在三娘的劝解下，抛开仇怨，带走两子修文与敦儒以避过李莫愁追杀。未几，李莫愁出现陆家庄，柯镇恶闻得消息赶来相助，但陆氏夫妇已被李莫愁打死，并胁持无双与程英，幸黄药师赶到救走程英，但无双被李莫愁带走，此时，杨过到来，见地上有毒针，不慎中毒，幸得欧阳锋为之解毒，欧阳锋见杨过精灵可爱，教他解毒之法。此时，欧阳锋见大雕飞过，知黄药师等人在附近，即抛下杨过而去。郭靖等人见杨过身中毒针，一问之下，方知杨过乃杨康之子，即带杨过返客栈疗伤。

郭靖等人返回桃花岛，途中见修文和敦儒在路上哭泣，知悉三娘已死，而三通则不知去向，遂带两人同行，更收两小孩为徒儿，但黄蓉想及当年杨康因她而死，未免养虎为患，诈称杨过由她教导，但只教杨过学习圣贤书，杨过感黄蓉偏私，心中不是味儿。欧阳锋到桃花岛欲带杨过离去，但被郭靖击退，杨过心中难过，杨过被修文、敦儒欺负，一怒之下用蛤蟆功对付二人，柯镇恶知杨过懂蛤蟆功，大为气恼，郭靖唯有送杨过往重阳宫学艺。

郭靖命杨过拜丘处机为师，丘处机命赵志敬教导杨过，但赵志敬对杨过有偏见，只教杨过背念口诀，不教运功之法。在小较之日，杨过因而出糗，但杨过不服气，将鹿清笃击倒，昏死地上，杨过大惊，慌忙逃进古墓，被孙婆婆救起。孙婆婆见杨过身世可怜，欲求小龙女留杨过在古墓暂住，但小龙女不想破坏门规，一口拒绝，但孙婆婆不忍杨过独自离去，遂找赵志敬晦气，却被众道士重重包围，脱身不得。

孙婆婆被赫大通击至重伤，小龙女现身，逼赫大通自刎，赫大通敌不过，正想自刎了断，幸丘处机及时赶到。孙婆婆临危想求小龙女收下杨过，照顾杨过一生，小龙女无奈答应收杨过为徒。三年后，杨过已逐渐长大成人，向其道出当年祖师林朝英与王重阳旧事：四十多年前，王重阳带兵抗金失败，自困古墓中，林朝英一番好意，七日七夜始将王重阳激离古墓，此后，两人成为一对风尘侠侣。林朝英一直希望安顿下来，但王重阳感匈奴未灭，无以为家，两人因而大战一场，难分高下，遂决定文斗，林朝英胜出后入住古墓，而王重阳则建立全真教，林朝英为此对王重阳恨之入骨，所以定下门规，古墓派弟子须斩断七情六欲。

霍都与赵志敬合谋对付小龙女，赵志敬安排霍都和达尔巴藏匿重阳宫内，霍都命赵志敬偷取禅房内古墓地图，但失手。杨过知悉小龙女生辰将至，特到重阳宫偷来小鸡，准备养大小鸡后替小龙女庆祝生辰。数月后，杨过果真将鸡制成佳肴为小龙女庆祝，但小龙女对鸡已生感情，不禁黯然神伤，小龙女猛然想起祖师遗训，感自己仍有七情六欲。