主人公。虽然外貌是小学生，但其真实身份是有名的高中生侦探工藤新一。被灌下黑衣组织开发的毒药回到了小学生的模样，但头脑没有改变，借助阿笠博士开发的侦探工具，解决了一个又一个困难案件。运动神经超群尤其擅长足球，但是个音痴。戴眼镜只是用来易容的。一直守护着青梅竹马的伙伴毛利兰。

工藤新一青梅竹马的女同学。与父亲小五郎和柯南3人生活在一起，不知道柯南的真实身份是新一。性格温柔，开朗活泼。在高中里是空手道部的队长，市里空手道比赛的冠军。一直惦记着以解决困难案件为理由而消失的新一，耐心的等着他回来。

在米花町开事务所的侦探。小兰的父亲，与妻子妃英理分居中。他虽然很清楚工藤新一是女儿小兰的青梅竹马，但是却完全没有察觉自己被柯南弄晕后解决了很多困难案件。拜其所赐，人称“沉睡的小五郎”。是偶像冲野洋子的铁杆粉丝。

帝丹高中二年级的学生。拥有卓越推理能力的高中生侦探。人称“平成的福尔摩斯”。足球水平是职业级的。虽与青梅竹马的小兰相互爱慕，但没能表白就被变成了柯南。他决定如果能彻底变回新一，就对小兰表白。

小兰的母亲，身材完美的美女。被称为“法律界的女王”，辩护起来，经常连审判长都抬不起头。思考事情的时候喜欢听音乐。虽然与小五郎分居中，但是经常惦记着小五郎。擅长编织。但是完全不会做饭。