西九龙重案组通过遗落在海底的宝石，第一时间联系买家了解情况，并且采集氧气瓶咬嘴的DNA，终将嫌疑目标锁定在死者女友身上。高级督察井浩然审讯嫌疑人，拆穿她和死者孙仲强以筹办聚会为由，合伙窃取宝石项链。 后来女友变心爱上黄坚，想要独吞宝石萌生歹念，趁着孙仲强准备下海打捞赃物，悄无声息地换掉氧气瓶，继而导致他因氮醉缺氧身亡。孙仲强女友据理力争，直到井浩然拿出租用氧气瓶的记录，这才供认不讳。 案件结束以后，法证部化验师余星柏和法医范佩清吃饭时，认真讨论关于氮含量的话题。余星柏亲自出海潜水实验，证实低含氧量的气瓶照样可以让人产生氮醉反应，范佩清知道他具有冒险和求知精神，早已是司空见惯，随口提及新任督察井浩然，迟早他们都要见面。 郊外村屋发生火灾，具体起火原因不明，余星柏委派徒弟湛霆跟随范佩清带队勘查，引起井浩然不满。由于现场唯一一具焦尸难以辨认，所以范佩清准备采取屋主任乐萍唾液进行比对，目前通过尸体没有逃生特征，初步判断为凶杀案件。范佩清留意到房间里摆放许多药品，为此感到疑惑好奇，屋主任乐萍表示自己曾是护士，又因弟弟妹妹体弱多病，索性多买些药品放在家里，以备不时之需。正说话间，任乐萍突然接到电话得知妹妹任乐盈遭人绑架，绑匪命令她准备一百万赎金。 重案组调取有关任乐萍的资料，发现她父亲任志辉早在十二年前出轨离家，母亲郭珊珊没多久去世，留下妹妹任乐盈和弟弟任乐行。姐弟三人相依为命多年，奈何任乐盈患有白血病以及肌肉萎缩症，至于任乐行则是严重哮喘，近期查出疑似肌肉萎缩。 也正因姐弟经历在媒体报道后，引起广泛关注，任乐萍辞掉护士工作之后，便在网上开通社交账户，日常发布他们的义工慈善信息。可是除此之外，没有任何信息有利于侦破，追踪电话毫无线索，绑匪要求明天必须缴纳赎金。 井浩然通知下属尽快调查任乐盈身边的可疑之人，反观法证部推敲焦尸极有可能是家务助理陈笑。湛霆等人讨论案情没有实质性进展，但是余星柏轻而易举指出问题所在，又在任乐盈指纹的血刀上发现绑匪血迹，两组基因图谱比对过后，结果说明绑匪和任乐盈存在亲子关系。任乐萍通过警方获悉绑匪就是任志辉，立马以网络直播的方式恳求他能放过妹妹，殊不知，这种做法变相激怒任志辉。范佩清对焦尸进行检验，发现死者并非是受到外来袭击引致肝脏以及骨髓损伤，而是源于低电压交流电。 自从任乐萍直播之后，村屋附近围堵众多媒体记者，事件疑似越闹越大。重案组得知任乐萍姐妹出行经常会由岑冠峰接送，便从他行车记录仪里寻找些蛛丝马迹，果然看见一辆多次出现在拍摄范围内的汽车。 依照汽车行踪轨迹，重案组连夜赶去废弃仓库，奈何任乐盈已被转移。井浩然发现门外两种不同的鞋印，便到任乐萍家附近守株待兔，没想到后半夜来人竟是余星柏，才知他是怀疑电死陈笑的真正凶器就在这里。 余星柏认为陈笑遭到袭击之后，肯定会用通讯器材向外界求救，果然在房间里发现平安钟已经被人改装。结合目前所掌握的信息，余星柏基本可以断定死者尝试用平安钟求救，同时打翻精油接触到漏电，产生火花引起火灾。医院初步做过核磁共振及血液检测，尚未发现导致任乐行双腿无力的原因，但是也不排除遗传性肌肉萎缩症状。井浩然来医院向任乐萍询问关于平安钟的事情，任志辉突然来电警告她凑足赎金，电话里还传出任乐盈的声音。 法证部提交平安钟的检查报告，完全符合余星柏的猜测。唐心陪着任乐萍去银行取钱，但是任乐萍表示自己取完钱要回家吃药，到时候会乘坐岑冠峰的顺风车。井浩然等人一路尾随岑冠峰，怎知他突然失控加速行驶，最终翻下山崖车毁人亡。 重案组在岑冠峰家里找到许多平安钟和束线带，看来是他改装任乐萍家的平安钟。任乐萍在警方的陪同下，焦急等待任志辉的电话，根据对方提供的地点去交赎金。重案组潜伏在人群里监视着情况，眼看着任乐萍将钱袋放入垃圾桶，直至可疑目标出现后，钱袋里的纸币居然全是白纸。

法医检验出岑冠峰血液里含有大量心安灵，属于正常用量的四倍，这种药物属于钙离子通道阻滞剂，服用过量会导致人体血压大幅度下降。根据医院提供的心电图记录，基本可以证明岑冠峰完全没有需要服用心安灵的心脏病史，也就意味着他是死于谋杀。 余星柏对比仓库门外鞋印，质疑任志辉或许还有同党。法证部接连查到重要线索，坐实岑冠峰在平安钟里动手脚导致陈笑触电身亡，以及他饮用掺有心安灵的咖啡，分量足以令人血压骤降、头晕甚至失去意识。 井浩然暗中监视等待绑匪出现，没想到赎金居然变成白纸，负责陪伴任乐萍的女警遭人袭击昏迷，任乐萍早已不在车内。范佩清来电透露七年前马克医院有过类似案件，病患死于钙离子通道阻滞剂中毒，尽管后来作为普通案件处理，可是当年内科病房护士正是任乐萍。 正如范佩清等人所料，重案组在任乐萍房间里发现心安灵，立马实施定位追踪，通过岑冠峰的私人手机，大概位置锁定在元朗四坑村。井浩然和唐心等人绕着村庄寻找任乐萍，怀疑她极有可能故意丢掉手机误导警方，果然警员通过云端查到她搜索过大树下南路的地方。然而等到重案组匆忙赶去时，看见任乐萍背后中刀气绝身亡，沿着血迹往废弃楼房寻去，任志辉已经倒在血泊里。任乐盈受惊过度送进医院，醒来后向警方讲述事情的来龙去脉，听闻参与绑架并且车祸身亡，瞬间崩溃痛哭。 至于任乐萍要谋害岑冠峰的真正动机，井浩然有理由怀疑是她知道岑冠峰和妹妹谈恋爱，也知道这个男人要杀自己，索性先下手为强。如今任志辉已死，法医部又发现维生素药瓶里查出沃力特，这种药物会导致低血压和肌肉抽搐，完全不利于任乐盈和任乐行的病情。 但是余星柏从岑冠峰车里找到湃健力药片，倘若服用沃力特会破坏电解质平衡，那么湃健力则是完全补充电解质。包括在任乐盈的报告里，完全看不到她患有骨髓白血病的记录，检查双腿肌肉完好，所以范佩清和余星柏商讨过后，共同认定任乐盈是在警方面前演戏。 当晚任乐盈给弟弟办理出院手续，约定要去国外旅行，可惜还未出医院大门，井浩然等人已经拦住去路。任乐盈面对井浩然的审讯，抵死不肯承认杀人罪行，可当法证部提交来新物证，心理防线彻底被击破。任乐盈如实坦白事实真相，包括不为人知的秘密，当年任乐萍想要在大家面前展现好姐姐的形象，每天都给她和任乐行下药。后来任乐盈和岑冠峰瞒着姐姐谈恋爱，并且在岑冠峰的建议下，决定伪造成姐姐触电身亡的假象，奈何计划全因任志辉的出现而终止。 任志辉为偿还高利贷才向女儿索要赎金，但是任乐盈以自己和弟弟的悲惨遭遇博得父亲同情，并且及时联系岑冠峰监视警方的一举一动，这也就是为何重案组抵达废弃仓库时，父女俩早已离开的原因。 本来任志辉跟任乐盈约定，只要拿到钱就平分赎金，任乐盈可以带着弟弟去别的地方生活。但是任乐萍没有想要放过任志辉，掏出事先准备好的匕首刺向对方，任乐盈躲在角落里目睹全程，趁她不注意从背后偷袭。 为了洗清自己的嫌疑，任乐盈清理案发现场，并且将匕首指纹抹去，嫁祸给任志辉和任乐萍同归于尽，唯独忽略衣服上的血迹，以及斜坡下的男士鞋子。虽然警方同情任乐盈姐弟，表示任乐萍不应该这么做，可她也无权利决定姐姐的生死。任乐盈在禁闭室上吊自杀无果，反而意外得知任乐萍患有代理型孟乔森综合征，一种虐待他人获取依赖和关注的心理疾病。任乐萍对妹妹弟弟以及马克医院的病人下药，还是因为内心深处渴望被人需要，范佩清希望任乐盈能够释怀仇恨，权当是为自己和弟弟好好活下去，只有留着性命才有机会体验到真正的幸福。 井浩然向余星柏表达感谢，然而余星柏故作高人傲娇，反倒是范佩清主动邀请他去酒吧喝两杯。两人合作多起案件得以侦破，越发感觉到默契，相较于之前的初印象，居然有种全新改观，看似古板又无趣的井浩然，居然也能在台上激情演奏。

香港校际音乐节隆重举办，范佩清受邀陪同嘉朗四手联弹，嘉朗父母在观众席上全程关注，直至演出圆满结束。昔日闺蜜悠悠为家庭放弃法医工作，备受丈夫宠爱之外，还在培养儿子嘉朗的钢琴天赋，如此美满人生令范佩清为之羡慕。 接下来的几天里，范佩清留意到信封被人拆开过，回家途中遭遇尾随，索性将计就计，联合余星柏引蛇出洞。余星柏事先在巷子里涂洒荧光剂，凭借着黑光灯追踪到附近茶餐厅，查看过前后门确定对方尚且在茶餐厅内。 正巧两名警察沿街巡逻，余星柏和范佩清主动向他们报警，并且说明情况。餐厅老板应要求关灯，荧光暴露出尾随者的位置，范佩清一眼认出他的身份，此人便是七年前情侣自杀案的当事人秦克男，没想到秦克男坚称是谋杀案，恳请范佩清能够重新调查。 虽然范佩清果断拒绝秦克男的要求，可她还是找出当年自杀案的新闻报道，患者陆诗诗和医生秦克男相爱，结果引来社会异样眼光舆论，就连院方领导都劝说秦克男尽快分手。陆诗诗为保护秦克男的名誉选择跳楼自杀，但是法医黄永权尸检过程中，意外发现陆诗诗血液里含有大量的那替明。所谓的那替明，实则是一种精神科药物成分，服用过量会引发癫痫以及心律不齐，所以检方结合黄永权给出的检查报告以及死者遗书，最终秦克男自杀协定罪成立。秦克男出狱后查到陆诗诗自杀前购买过舞鞋，坚定认为她是被人毒害，从而萌生出翻案的想法。 谭倩雯兼职公关参加米歇尔的酒会，结果遭到老外咸猪手，激烈反抗引起米歇尔的不满，幸好公关负责人韦建邦及时出现。米歇尔看在韦建邦的面子上没有深究，让他等酒会结束后到自己房里，韦建邦看出谭倩雯的担忧，安慰她不必担心自己。 由于谭倩雯饱受失眠困扰，通过网络结识相同遭遇的网友，并且在线下齐聚温馨小屋，相处起来格外融洽。组员龙友分享上次在墓地听到风铃声入眠，谭倩雯鼓起勇气去墓地，没想到遇见同为组员的井浩然，二人有说有笑坐到天亮。重案组接到命案后，第一时间赶往现场勘查，初步判断米歇尔死于勒杀，保险箱内的财物不翼而飞。警方逐个排查案发之时的相关人员，唯独韦建邦越查越可疑，无论是他脸上的伤口，亦或是口供笔录。 法医张世熙亲自检验死者指甲残留物，并且推断米歇尔死亡时间是凌晨一点到两点半，也就是宴会结束之后。如此看来韦建邦没有提及他和米歇尔吵架的事情，显然是要刻意隐瞒，谭倩雯坚信韦建邦没有杀人动机，表示自己坐车离开宴会时，注意到车窗外一位穿着黑色衣服的人走上山，奈何天黑看不出任何特征。 范佩清偶遇帮助她抓秦克男的女警霍宝英，二人交谈间，怎知秦克男突然来找范佩清，重提七年前的案件。古惑仔阻拦范佩清解刨忠爷，失手捅伤狱警造成他肝脏大量出血，场面一度陷入混乱，还有人不慎弄洒漂白水，混合狱警失禁的尿液产生氯氨气体。 毒气在短时间内导致众人中毒，秦克男不顾自身安危跑来帮忙，通知大家先出去，而他留下来给狱警输送新鲜血液，保证他生命能够坚持到救护车出现。古惑仔承认这次是自己的问题，可他依然警告范佩清不要妄想在忠爷身上动刀，说完就扬长离去。秦克男吸过氧气已经安然无恙，霍宝英看着他独自站在不远处的角落里，试探询问范佩清是否考虑翻案，毕竟通过这件事情让她对秦克男有所改观。范佩清表示当年尸检过程没有任何问题，就算是霍宝英处于普通人立场抱有同情心，依旧无法改变客观事实的存在。

当年范佩清作为黄永权的助理，收到指示帮忙处理一起死因调查，并且给出相应的尸检报告，成为检方控告秦克男的有力证据。可时至今日，范佩清陷入自我怀疑，为能寻求真相，委托余星柏代她上门拜访黄永权。余星柏在门外遇见霍宝英，二人走进房间发现黄永权突发疾病去世已久。 自从米歇尔案件发生之后，韦建邦遭到公司同事和社会各界的非议，而他也主动承认自己曾经为生意会和客户上床，但是现在已经改过自新，回归家庭。正当建邦向大家保证会好好经营公司之时，重案组以劫杀案对他实施逮捕，带回警署接受审讯。 韦建邦自知瞒不下去，如实交代自己之所以会和米歇尔吵架，其实是拒绝对方提出上床的要求，所以米歇尔一怒之下打了他耳光，甚至还在酒水里下药。可是法证部调查现场，除了韦建邦和米歇尔以外，完全没有第三人在场，也就意味着韦建邦即将面临谋杀控诉。 谭倩雯不遗余力要给建邦寻找证据，奈何案发现场外部环境存在监控盲区，包括接送谭倩雯的出租车未装记录仪，关于黑衣人的线索毫无头绪。井浩然表示他们就算是锁定疑犯，并不代表会停止调查，反而好奇谭建为何如此关心韦建邦。当井浩然问及这件事情，谭倩雯坦言韦建邦是个很爱老婆的男人，年轻时和她在同一家公司工作，后来为能重新挽留妻子付出许多。所以谭倩雯明白失去又拥有的珍贵，因为坚信韦建邦的人品，也知道他是无辜清白。 黄永权的妻子过世，又无子女依靠，生前患有癌症晚期，知晓自己时日无多才联系义工机构处理后事。霍宝英和余星柏想要从黄永权的验尸手稿寻找些蛛丝马迹，可是手稿还没找到，意外发现黄永权年轻时和小男孩的合影，以及明天风筝会周年比赛。 余星柏觉得若是找到小男孩，或许会有手稿的下落，于是连夜制作好金鱼风筝，次日带着霍宝英去参加风筝大会。偏巧碰上风向不稳定，风筝大会提前结束，霍宝英不肯放弃坚持要放风筝，幸好皇天不负苦心人，终究还是让她遇到照片里的男孩，如今已经长大成人。 可惜男人去国外之后，很少和黄永权联系，根本不知道验尸手稿。霍宝英并不气馁，她认为手稿没有线索，至少也算是帮助黄永权完成心愿，高兴之余连喝两瓶啤酒，没多久就烂醉如泥，余星柏无奈用特殊方式让她醒酒。此时霍宝英接到男人电话，得知黄永权常去一家名为“木”的咖啡店，意外收获已经出版成小众书籍的验尸手稿。法院开庭审理米歇尔的劫杀案，重案组和法证部陆续出庭作证，还有报告显示死者生前抓伤建邦，指甲残留其皮肤组织。纵然建邦据理力争，否认自己杀人，终究无法改变无期徒刑的判决结果。 谭倩雯为保护建邦妻儿，正面回怼无良媒体记者，井浩然及时出面护送他们回去。当晚组员齐聚小屋，井浩然隐约听到隔壁房间传来鼓声，开门查看发现是谭倩雯敲鼓泄愤，他只能默默离开。 熊承宇出狱后成为地方老大，因为记挂着秦克男的恩情，对他也是有求必应。秦克男知道范佩清解刨忠爷肯定遭到古惑仔报复，从他身边调走手下去保护范佩清，怎知古惑仔是来向她道歉，原来她顺着忠爷的纹身开刀，在不违反尸检程序的前提下，还变相保住忠爷的面子。 既然是误会一场，秦克男英雄救美毫无意义，但是范佩清决定要帮他重新调查陆诗诗真正死因。秦克男推测凶手熟悉药理，也许陆诗诗使用的按摩膏是对方提供，二人分头行动调查按摩膏来源，在一家药妆店查到线索，获悉陆诗诗每逢周末会去买东西，并且去上烹饪课。余星柏翻看黄永权撰写的尸检报告书籍，看到他在自杀案里说明有人将那替明混入草莓口味的大福糕点，立马跟霍宝英亲手制作大福尝试如何掩盖药苦味，无一例外全都失败。联想到陆诗诗血液中含有高量糖蛋白，余星柏让霍宝英去采购各式各样的水果，结果发现掺有蜜拉圣果的大福完全尝不出苦味。

正是因为蜜拉圣果的主要成分是扰乱味蕾，所以就算是大福里添加那替明，也基本是很难让人察觉到苦药味。凶手能够想到用甜品杀人，还将杀人计划部署如此精密，秦克男深感无力，实在想不明白对方的真正动机。幸好秦克男已经通过网络联系到烹饪教室的学员，约定明天在指定地点见面，而他邀请范佩清一同前往，获取烹饪食谱之余，意外得知陆诗诗在烹饪班和嫣妮丝颇为熟识，有次嫣妮丝向陆诗诗哭诉自己压力大，希望她能帮忙拿些治疗失眠的药品。 秦克男带着范佩清陆续走访烹饪教室的学员，并且拿到关于全体合影照片，二人都不由愣住，原来所谓的嫣妮丝竟是悠悠，也就是秦克男的前女友。范佩清检查周围是否还有其他线索，顺手打开一扇房门，随之爆炸扑面而来，秦克男急忙将她护在怀里，侥幸逃过一劫。事件发生之后，秦克男需得留院观察情况，至于范佩清尚无大碍。法证部勘查现场推测有人利用射灯的高温制造粉尘爆炸，余星柏在墙壁处发现遗落的纽扣，凭借技术还原梅花图案，又鉴定出面粉是从日本进口的牌子，专门用做蛋糕烘焙。范佩清有理由怀疑闺蜜悠悠参与到七年前的自杀案，当她拿出陆诗诗经常使用的按摩膏产品，已然看出悠悠表情变得奇怪。尽管悠悠故作镇定不予理会，可她和秦克男的恋人关系也是事实，当初秦克男无法忍受悠悠的强势，最终选择结束长达八年的爱情长跑。后来悠悠知道秦克男移情别恋，便用嫣妮丝的名字到烹饪教室上课，故意接近陆诗诗，和她成为好朋友。陆诗诗完全没有防备之心，甚至愿意编谎话帮助悠悠去拿药物，但是范佩清知道悠悠是想要报复陆诗诗和秦克男。 如今范佩清找到悠悠，无非是希望她能回头，不要继续一错再错。然而悠悠全程沉默不语，直至范佩清起身离开，她忽然接到丈夫姚舜宏的电话，神色越发凝重。此刻姚舜宏已在审讯室面对警方询问，重案组早已搜集足够证据指控他意图引发尘暴杀人。案发现场找到的樱花纽扣出自姚舜宏的甜品店，还发现汽车后备箱的面粉和店铺面粉，都属于同一种牌子。 井浩然查到姚舜宏七年前从日本归来，以客席导师身份在烹饪教室任教，所以学校资料根本没有姚舜宏的名字。正当井浩然认定姚舜宏是杀害陆诗诗的凶手，重案组又在姚舜宏租用的迷你仓里盛装大福的餐盒，上面检验出秦克男的NDA，以及姚舜宏偷拍陆诗诗的照片。眼看事实证据摆在眼前，姚舜宏承认自己七年前痴迷陆诗诗，私下里偷拍很多照片，怎知陆诗诗发现大骂他是变态，扬言要报警处理。姚舜宏恼羞成怒，为避免事情闹大，情急之下想到要杀人灭口。虽然看似案件了结，实则另有隐情，范佩清主动去找悠悠，认定她才是杀害陆诗诗的真正凶手。因为每个人拍照习惯不同，姚舜宏喜欢将人物置中，可唯独陆诗诗的照片失焦，而且还在边缘位置，也就意味着他照片里的女主角正是悠悠。 范佩清拆穿悠悠早有预谋做好掺有那替明的草莓大福，继而装进和陆诗诗同款的餐盒里，趁其不备换走餐盒，这一幕落入姚舜宏的视线里。正是姚舜宏太爱悠悠，才会默默捡走悠悠丢在垃圾桶里的罪证，整整保存七年的餐盒，需要靠它来给悠悠顶罪。所以之后的尘爆、遗落现场的纽扣，以及在迷你仓找到的证据，全都是姚舜宏保护心爱之人的用心良苦。范佩清想让悠悠明白自己犯下的错误，应该由自己来承担，这也是当初她成为法医的准则，倘若真的选择逃避法律审判，恐怕连儿子嘉朗都会感到失望。 悠悠回到家里看着丈夫写给自己的信，脑海里浮现出昔日的美好点滴，终在此刻幡然醒悟，意识到丈夫对自己的深情。次日重案组准备移送姚舜宏之时，忽然看见悠悠在范佩清的陪同下来到警局，主动交代犯罪经过，为七年前的错误承担责任。随着自杀案尘埃落定，涉案凶手皆已伏法，秦克男坐在观众席上看着嘉朗演出时，仿佛观看陆诗诗在聚光灯下跳芭蕾，内心得以释怀。范佩清答应悠悠会照顾好嘉朗，同时好奇秦克男对未来如何打算，秦克男还未想好之后的规划，但他很感谢范佩清和余星柏等人的帮助。余星柏趁着同事们去聚餐，准备独自在办公室享用美食，没想到霍宝英突然过来要和他庆祝自杀案告破。也正因霍宝英参与侦破这起旧案，直接从巡警调往西九龙区重案组，田七、小夫等一众警员热烈欢迎，唯独井浩然依旧是冷酷模样。