故事开篇，路上行人全被一只孔雀吸入腹中，吐出后皆是白骨。此时，远处一位身周万丈光芒的穹高正在和“水头像”奎刚进行对峙。原来奎刚竟然是穹高在修炼过程中的痛苦和仇恨，所幻化成的独自个体。代表黑暗的奎刚，在这场对峙中最终败给了代表光明的穹高，穹高也被太上老君推举为玉帝。然而此时，孔雀却将穹高和奎刚变成的黑莲一起吞入腹中。玉帝打败孔雀并为己所用，又恐奎刚所变成的黑莲会借着孔雀的力量重新幻化，决定请三界第一巧手阿依那伐将黑莲从孔雀腹中取出。但奎刚用变化骗过了阿依那伐，阿依那伐取出的黑莲并不是奎刚的元神黑莲。实际上奎刚早已提前幻化了。而从奎刚幻化的那一刻起，一场五百年后的浩劫就注定要产生。阿修罗界位于三界的缝隙之内，只有邪魔和恶灵才能够在这里生存。在这里，奎刚赐予众妖肉身，并有了自己的一众跟随者。奎刚为了获得肉身，需要在人间收集九百九十九个男人的阳气，九百九十九对童男童女的精血以及九百九十九个姹女的阴精。但由于阿修罗界的妖怪对人间并不熟悉，要想收集这些，需要获得重华宫中妖怪的帮助。故事开篇，路上行人全被一只孔雀吸入腹中，吐出后皆是白骨。此时，远处一位身周万丈光芒的穹高正在和“水头…九十九个姹女的阴精。但由于阿修罗界的妖怪对人间并不熟悉，要想收集这些，需要获得重华宫中妖怪的帮助。

奎刚借助黑鸦大王的身体进入天界，并威逼利诱武德星君放上古巨怪蜃、九婴和巨蝎下界。奎刚故意制造天界混乱，声东击西，而武德星君趁奎刚与哪吒混战之时，放出古巨怪蜃、九婴和巨蝎。这个突袭者实力非凡，而且竟然会使用只有玉帝才会的五雷决法，令众人感到十分诧异。天界众人经过一番推测，断定其为奎刚，并判断重华宫逃走的蜃、九婴、巨蝎三怪也与奎刚有关。奎刚委蜃全权，九婴、巨蝎从旁辅佐。并遣蜃、九婴和巨蝎下界为妖，命他们抓捕阳男姹女及童婴，每样九百九十九之数，总共三千九百九十六人，而后送至阿修罗界。玉帝告诉众人，五百年后的劫数必然到来，然此厄很快可解，但必须找到一位三界大护法。该护法必须天生地长，肉身成圣，既不在天地海众神之列，更 不是世间的凡人。玉帝命哪吒找到该位三界大护法，并传授他神功。哪吒查阅天籍，终找到了符合三界大护法条件的灵石--泰山玉皇顶的九灵石。同时玉帝也杨戬 寻找蜃、九婴和巨蝎的下落，并将他们一网打尽。同时，奎刚也获得了玉帝正在寻找护法大师--九灵石的消息。奎刚命令蜃、九婴和巨蝎到泰山玉皇顶找到九灵石，等其孕化成人形，立即除掉。

在晨曦微露之时，泰山玉皇顶的灵石--石敢当破石而出。此时哪吒发现了蜃、九婴和巨蝎。蜃谎称自己是泰山绝顶的九灵石，骗取了哪吒的信任，令哪 吒收其为徒、并传授其神力。骗过了哪吒之后，蜃找到了九灵石。蜃、九婴和巨蝎三人合力试图杀害九灵石石敢当，没想到石敢当实力超群，在混战中，石敢当逃脱 了。杨戬此时看到一股强劲的白光，断定是是下界的妖蜃、九婴和巨蝎所发出。但蜃认出了杨戬的身份，声称自己是三界护法九灵石，并称九婴和巨蝎是精凌松子和绿琮仙子。由于蜃拿出了哪吒给他的册子，杨戬相信了他们。此外，蜃还骗杨戬去找石敢当，想借助杨戬之力解决掉石敢当。此时，由于石敢当状似人形，然额头异象，胸前背后，覆盖晶石毛羽，和常人十分不同。因此在村落中被当成了妖怪。众村民一起冲上前来，棍棒齐下， 石敢当挣扎着向村外奔去。在汴梁，石敢当饿极了，只好抓起摊上炸好的豆腐吃起来。没想到豆腐店老板上告公差，石敢当被当做妖怪抓了起来。董推官见石敢当长 相奇异，为了讨好笃信神仙鬼道的圣上，决定将石敢当交予皇上。

术士告诉皇上，石敢当是天生地长的石精，最适合做长生不老药丸的引子。皇上虽有不忍，但念其并非人身，最终同意。术士在逼石敢当现行不成之后，决定将其塞入炼丹炉中，将其炼化。没想到石敢当在烈火炼化之下依然活着。最终术士决定将其脑袋砍下后，再将头颅、 尸体放进丹炉中抟炼。然而在刽子手砍石敢当的头颅之际，石敢当发出的巨大冲击波竟将周围的卫士震飞、术士震死。并且与此同时，石敢当肋生双翅，飞起空中， 不见了踪迹。在云雾山中，猎户兄妹朱半斤、朱玉莲发现了被烧得一动不动的石敢当。石敢当看到朱半斤和朱玉莲，十分惊恐，不敢与之交谈。朱半斤虽然不太情愿， 但是由于朱玉莲的坚持，二人将石敢当带回家中收留他，并帮助石敢当治疗身上的烧伤。石敢当谈起从幻化成人到现在的经历泣不成声，对于兄妹二人的帮助行为非 常感激。在兄妹家里，石敢当不仅能搬得动六七百斤的草垛，还能爬到绝壁顶端摘下千年灵芝。杨戬回忆起当时白光，认为当日泰山所见的那股原力之强远超过自己，开始怀疑是不是是不是蜃、九婴和巨蝎三怪的元神。

在首阳山上坐落着一座极为豪华的庄园。这位庄园一夜之间拔地而起，村民感到非常奇怪，猜测为神仙点化。众村民进入后却发现庄园突然消失，自己身处洞穴之中，想要逃跑却已经来不及。此时蜃、九婴、巨蝎三人所诱捕的阳男已有近百人了，但单凭这座首阳山庄想凑足这四千之数依然非常困难。蜃决定联络各路精怪前来助阵。石敢当、朱半斤、朱玉莲靠打柴小赚了一笔，想在布摊买些布做新衣服。此时，开封府的捕快头子的儿子想强抢玉莲，被朱半斤狠揍了一顿。过了一会，李衙内领着十几个打手冲上前来，朱半斤寡不敌众，朱玉莲也被抢走。而石敢当由于害怕，既没有帮助朱半斤，也没有保护好朱玉莲。入夜时分，朱半斤和石敢当前去李衙内家中营救玉莲。石敢当非常害怕，只能由朱半斤负责引开李衙内后，朱半斤再去救玉莲，待救出玉莲后再帮助朱半斤飞出高墙。救出玉莲后，石敢当为自己之前的行为感到很悔恨。认为兄妹二人对他那么好，他胆子却那么小，实在对不起玉莲。玉莲耐心安慰他，劝他不要做“东郭先生”。两人情愫暗生。李衙内打听到兄妹二人的住处，带领打手到兄妹二人家里绑走了朱玉莲。石敢当开始很害怕不敢出手，经过挣扎后终于出手打走了李衙内，救下了玉莲，并称不再做“东郭先生”。