• 1.摘要
  • 2.基本信息
  • 3.基本内容
  • 4.参考资料

反向重复序列

反向重复序列指两个序列相同的拷贝在DNA链上呈反向排列, 是DNA重复序列的一种类型。反向重复序列散布在整个基因组中,约占人类基因组中占5%,常见于基因的调控区,可能与基因的转录、复制有关。反向重复序列的一种形式是反向排列的两个拷贝间隔着一段序列,另一种 形式是两个拷贝之间没有间隔序列,呈反向串联,这种结构又称回文式序列。1

基本信息

  • 中文名

    反向重复序列

  • 外文名

    inverted repeat sequence

  • 类型

    专有名词

  • 领域

    生物基因

  • x学科标签

    分子生物学

基本内容

反向重复序列 (inverted repeat sequence):

如图一GTGCTAA和TTAGCAC构成反向重复序列。在双链DNA中反向重复可能引起十字形结构的形成。(图一上面的序列为反向重复序列,同时,注意到它两条链顺读是一样的,且中间没有间隔序列,因此它是回文序列;图一下面的序列为镜像重复序列。详情参见下文辨析。)

回文结构(palindromic structure):

在真核细胞染色质DNA分子中,还存在大量特殊的序列,这种结构中脱氧核苷酸的排列在DNA两条链中顺读与倒读其意义是一样的,脱氧核苷酸的排列

对于一个假象的轴成180°旋转对称,这种结构称为回文结构。

几种重复序列辨析(非正式名词解释):

反向重复序列(Inverted repeat sequence)

5'AAAANNNNTTTT3'3'TTTTNNNNAAAA5'

两条链中以5'->3'方向读出来是一样的,两条链旋转对称。

回文序列(Palindromic sequence)

5'AAAATTTT3'3'TTTTAAAA5'

当反向重复序列中没有“NNNN”时就称为回文序列,两条链旋转对称。

正向重读序列(Direct repeats sequence)

5'ATCGNNNNATCG3'3'TAGCNNNNTAGC5'

在同一条序列中有重复(NNNN的前后序列都是AAAA),中间的NNNN可有可无。

镜像重复序列(Mirror repeats)

5'ATCGNNNNGCTA3'3'TAGCNNNNCGAT5'

两条链都呈轴对称。

参考资料

  • 1
    官大威法医学辞典化学工业出版社2009年