污泥细小亚硝化菌
基本信息
- 中文名
污泥细小亚硝化菌
- 外文名
Nitrosotenuis cloacae
- 界
古菌界(Archaea)
- 门
奇古菌门(Thaumarchaeota)
- 属
细小亚硝化菌属(Nitrosotenuis)
- 发现地
污水处理厂
生理生化特性
进化地位和菌株分布
Nitrosotenuis cloacae的第一个菌株名为SAT1，经过amoA基因系统发育鉴定，该菌属于古菌中的Group I.1a。按照park等人的分类方法，可进一步归属于污水AOA分支B（Wastewater Cluster B，原文中简称WWC-B）。该分支的AOA在世界各地的多个污水处理系统中均被发现，是污水处理系统中AOA的一个比较重要分支。
根据目前已有的资料分析，该菌目前广泛分布于淡水湖泊，污水处理系统，饮用水处理系统等低盐度的环境中。
生长速率和营养性
通过生长试验，测定出菌株SAT1的比生长速率为0.25 d-1，比氨氧化速率为3.8 fmol cell-1d-1，与其他氨氧化古菌相当。由稳定同位素标记（SIP）试验，证实了该菌可以利用13C标记的NaHCO3，因而可以进行自养生长。
菌株活性的影响因素
该菌株SAT1最适pH为6.0，最适温度为29℃，氨氮和亚硝态氮耐受上限均为3mM。盐度耐受上限仅为0.03%，等价于电导率约647µS/cm，无耐盐能力，但能适应175µS/cm的低渗透压环境。对氨氧化抑制剂烯丙基硫脲（ATU）的耐受极限较高，大于500µM。其余一些生理生化特性请见文献原文。
基因组特性
除了试验测定其生理生化特性之外，研究者还在同一篇文献中完整地测定了该菌的全基因组序列。完整序列总长为1.62Mb，采用NCBI的PGAP注释流程对基因组进行注释，注释结果中包含1855个基因。目前全部基因组序列已经上传到GenBank数据库，登录号为CP011097.21。
缺失的尿素转运蛋白
很有意思的是，与目前已经发现的其他AOA基因组不同，SAT1的基因组中虽然包含一整套尿素降解相关基因，但其中的尿素转运蛋白基因（UT）却是一个被重组打断的假基因。这导致SAT1菌株失去了尿素转运的功能，因而也无法利用尿素。这也得到了尿素培养试验的证实。据推测，这一假基因是进化过程中的遗迹，在其他AOA中尚未出现这样的情况。
基因组大片段的翻转
