历史

英国记者和政客Ian Gilmour引用了圣巴托洛缪大屠杀作为一个实例比较基督教恐怖主义与现代恐怖主义，并写道:“教皇额我略十三世说这大屠杀给了他比勒班陀战役更多的快乐，他委托乔尔乔·瓦萨里在梵蒂冈描绘壁画。” 大约2000至25000雨格诺派（也译做胡格诺派，法国新教徒）被天主教暴徒杀害了，它被称为“那个世纪最严重的基督教屠杀”。这次大屠杀导致开始了第四次法国宗教战争，双方许多其他大屠杀和暗杀都找这次大屠杀做借口。Peter Steinfels 列举了火药阴谋作为一个历史上明显的基督教恐怖主义例子，当时盖伊·福克斯与其他天主教革命家想炸毁威斯敏斯特宫企图推翻英国的新教政权。

各国的机构与行为

加拿大

从俄罗斯基督教无政府主义教派分支Doukhobor来的自由之子因反对在公共场所裸露身体而炸毁电塔、铁路、桥和烧毁往往是他们自己的住所。

印度

国家防止恐怖活动纪念馆认定的世界上最活跃的十个恐怖主义组织之一，起源于印度东北部特里普拉邦的叛乱集团特里普拉民族解放阵线，被指控暴力强迫民众信仰基督教。

National Socialist Council of Nagaland (NSCN)领导了那加兰邦的叛乱，直到现在还与它的军队持续中。Isaac Muivah明确地指它是"Nagalim for Christ."

北爱尔兰

橙色志愿者是对天主教教堂发动恐怖袭击的原教旨基督新教准军事部队。

罗马尼亚

在罗马尼亚反犹太主义的罗马尼亚正教会法西斯主义运动，例如铁卫队和Lăncieri，在犹太人大屠杀、布加勒斯特大屠杀及30年代的政治性的谋杀有责任。

俄罗斯

有一些俄罗斯的政治和准军事团体结合种族主义，民族主义及俄罗斯东正教信念。

一个极右极端民族主义政党及准军事部队组织俄罗斯国家联合，根据其宣言提倡俄罗斯东正教堂更大的角色。它被指控谋杀和几个恐怖袭击，包括炸毁在叶卡捷琳堡的美国领事馆。

乌干达

圣灵抵抗军是对乌干达政府叛乱的邪教游击队，该游击队被指控使用儿童兵和大量危害人类罪，包括屠杀，绑架，断肢，酷刑，强奸，搬运工和性奴隶。

这是约瑟夫科尼所领导，他主要认为阿乔利人信仰的基督教圣灵可以代表许多表现形式并且宣称他是耶和华的代言人和灵媒。圣灵抵抗军战士穿戴玫瑰经念珠，并在战斗前吟诵圣经的章节。

美国