西二旗站是北京地铁13号线和北京地铁昌平线的换乘车站。位于北京市海淀区上地科技园区信息路东北面，在13号线上的编号是1306。原13号线上的西二旗站于2002年9月28日13号线西段线路开通时投入使用，在现址南侧，在2010年12月25日，为了配合昌平线开通，西二旗站移往北侧新址，以进行换乘，而老站将保留作他用 。昌平线部分于2010年12月30日随昌平线一期开通投入使用。
位置
该站位于上地科技园区信息路东北面，西临上地东路以及高架的G7京新高速公路，东临京包铁路。昌平线与13号线与京新高速公路、京包铁路平行，呈西北-东南走向布置。 西二旗站地理位置图 本数据来源于百度地图，最终结果以百度地图数据为准。
结构
原有西二旗站由于设计规模过小，无法满足与昌平线换乘需求，同时对既有站进行改造的风险较大，因此配合昌平线建设，在老站北侧增建了新站。新站与老站相距38.7米。
西二旗新站结构为地上两层，半地下一层，四柱五跨车站，总建筑面积16669.6平方米。利用13号线与周边既有高差设置半地下层为设备和管理用房；地上一层西侧为站厅、进出站通道，东侧为13号线站台；二层西侧站厅上方为昌平线站台，东侧13号线站台上空为13号线换向天桥暨换乘通道。两线均采用侧式站台设计，昌平线西侧站台宽7米，东侧站台宽5.2米；13号线西侧站台宽4.8米，东侧站台宽4.5米。为了避免影响13号线运营，13号线站台采用了悬挑结构。
由于车站东侧是京包铁路，出站口均设在西侧，因此，13号线东直门方向站台须经过二层天桥跨过13号线路轨经西直门方向一侧站台后经站厅进出站。
西二旗站外形顶部用的膜结构覆盖，外立面采用PTFE索膜结构，模仿手风琴状起伏褶皱的外观效果。
昌平线一期工程完工后，路轨暂时到西二旗站为止，未来将继续向南延伸。为了给昌平线南延提供空间，西二旗老站将被拆除。
西二旗站西南侧新设有P+R停车场，占地面积7400平方米，可停放191辆车。
出入口
新西二旗站共建有5个出入口：北 (A1、A2)、南 (B1、B2、B3) 口（其中B2口暂未启用）。A口有无障碍设施。
原有的西二旗站有1个出入口：A（西）。
运营
13号线西二旗站既有大量乘客上车又有大量乘客下车，因此早高峰十分拥挤，经常有下车乘客被上车的人群挤回车厢。2013年西二旗站早高峰的视频被上传至YouTube，一天之内获得点击量超过33万次，登上热门视频排行首位 。
首末车时间
13号线
开往西直门：5:10-23:17
开往东直门：5:52-22:58（全程）-0:01（终点站霍营站）
昌平线
