概念

DNA甲基化免疫共沉淀技术(MeDIP or mDIP) ，是一个大范围的染色体或基因组纯化技术，在分子生物学中被用于富集DNA甲基化序列。

它是通过5-甲基胞嘧啶（5mc）抗体富集高甲基化的DNA片段，并结合第二代高通量测序，对富集到的DNA片段进行测序，从而检测全基因组范围内的甲基化位点。

最先由Weber M.et al提出。这项技术为DNA甲基化水平的测定铺平了道路，因为这项技术使DNA甲基化净化率可以输入高通量DNA检测仪中，例如高分辨率微阵列（medip-chip）或下一代测序技术（medip-seq）。然而，对甲基化组的理解仍然很有限。像其他表观遗传学现象一样，甲基化水平的研究受到不同细胞型需要不同研究模式而使研究工作变得非常复杂。1

背景

DNA甲基化对生命活动非常重要，是基因调控的手段之一（即，通过对位于启动子及第一外显子区的CpG岛的甲基化而抑制基因的表达），它在维持细胞正常功能、传递基因组印记，胚胎发育、肿瘤发生等方面起着至关重要的作用，更是表观遗传学研究的热点。2

对于DNA甲基化的检测，采用：甲基化DNA富集并结合高通量测序（MBD-Seq, Methylated DNABinding Domain-Sequencing）的方法。MBD-Seq的原理是：由于在哺乳动物中甲基化一般发生在CpG的胞嘧啶5位碳原子上，所以可通过特异性结合甲基化DNA的蛋白MBD2b或5’-甲基胞嘧啶抗体富集高甲基化的DNA片段，并结合第二代高通量测序，对富集到的DNA片段进行测序，从而检测全基因组范围内的甲基化位点。

局限性

MeDIP应用过程中需要注意的是实验中的经典注意事项。包括质量和交叉反应的5mc抗体使用过程。此外，DNA检测技术（阵列杂交和高通量测序）都会涉及常见的局限性。最典型的限制是，需要使用高通量测序。3

参考资料