重复序列
DNA序列可按照其在基因组中出现的次数分为单一序列和重复序列。重复序列系指基因组中重复出现的DNA序列,占人基因组至少50%。根据重复次数可以分为,中度重复序列(10^2~10^5)和高度重复序列。根据来源和分布特点又可以分为串联重复和分散重复。
基本信息
- 中文名
重复序列
- 序列类型
3类
- 类别
生物技术
- 优点
有助于科学研究
简介
称后者为重复顺序。组成基因组的DNA顺序,根据其重复的频度可分为三类。一是基因组只有一个复制顺序的单一DNA,二为高度重复顺序(highly repetitivesequence),由较短的顺序105—107次直线连结而成,其中含随体DNA等。第三为中等程度的重复顺序(moderately repetitive sequence),为有300—500个核苷对的大致相同的顺序——例如在将哺乳类的DNA用限制酶AluI(AG↓CT)切断时所产主的主要片断中所见到的高频率(105)的顺序(AluIfamily)——与单一DNA一起分散存在的,以及像核糖体RNA基因或组蛋白基因群那样的多次成直线相连存在的(多基因群)都包含在这一类中。此外有在反方向上重复的顺序(inverted repetitive seq-uence),其变性DNA折叠成发夹结构(hairpinstructure,foldback structure,snapback stru-cture),在编码分析中可迅速再结合的类型。
染色体上存在的大量无转录活性的重复DNA序列。其组织形式有两种:串联重复序列;分散重复序列。前一种成簇存在于染色体的特定区域,后一种分散于染色体的各位点上。
类型
高度重复序列
重复次数>10^5次。卫星DNA、小卫星DNA和微卫星DNA按照重复次数属于高度重复序列,按照分布特点属于串联重复序列。
中度重复序列
重复次数为10^2~10^5次。在小鼠中约占20%。如rRNA基因、tRNA基因和某些蛋白质(如组蛋白、肌动蛋白、角蛋白等)的基因。
单拷贝序列
就是在整个基因组中独有的一段序列,没有与它相似的重复片段。它占到哺乳动物核酸含量的50%~60%。
轻度重复序列
是指重复2~10次的一些序列,例如tRNA基因和一些组蛋白基因;