雷红星
雷红星博士于1991年获华中理工大学生物医学工程学士学位,随后7年在军事医学科学院工作。2003年在美国堪萨斯州立大学获博士学位。此后,在段勇研究组从事5年的博士后研究同时担任研究组主管,其中一年在美国德拉华大学,其余四年在美国加州大学戴维斯分校工作。2008年6月,雷博士加盟北京基因组研究所,被聘为“百人计划”研究员。
基本信息
- 中文名
雷红星
- 国籍
中国
- 民族
汉
- 主要成就
首次将天然蛋白质折叠提高到0.5埃米的精度
- 职务
博士生导师
- 职称
研究员
简介
雷博士从1991年就一直从事计算生物学方面的研究。从1991年至1998年,主攻方向为生物信息学,广泛学习了蛋白质和核酸的系列分析方面的计算技术, 作为主要参与者开发了国内第一套生物信息软件包--GOLDKEY。1998年后,研究方向从生物信息学转为计算结构生物学方面。使用分子力学和分子动力学作为主要的研究方法,研究内容主要包括蛋白质折叠,蛋白质-蛋白质对接,蛋白质结构模建,蛋白质动力学,以及蛋白质病变聚合机理等。在蛋白质折叠的研究中,首次将天然蛋白质折叠提高到0.5埃米的精度。
研究方向
结构生物学,包括蛋白质-蛋白质相互作用,蛋白质-DNA相互作用,蛋白质折叠,以及蛋白质结构及功能预测.系统生物学, 包括蛋白质-蛋白质相互作用网络和转录调控网络。目前主要从系统网络的角度研究老年痴呆症的机理
主要研究成果
1) 通过计算模拟首次完成天然蛋白质亚埃精度的折叠
2) 成功地将多个天然蛋白的折叠精度提高到1埃内
3) 揭示蛋白折叠中分步折叠的机理
4) 开展了淀粉样肽聚集化的早期模拟研究
5) 开展抑制淀粉样蛋白形成的早期模拟研究
6) 蛋白-蛋白对接中分子间距离的创新性研究
7) 通过模拟完成β-肽的可逆性折叠的最早期研究
8) 合作开发国内最早的生物信息学软件
主要研究领域
一、计算结构生物学:
1 蛋白质-蛋白质对接
大多数细胞过程是由蛋白质-蛋白质相互作用来实现的,从单独的蛋白质结构出发预测蛋白质-蛋白质相互作用的三维结构(蛋白质对接)能够揭示它们的功能机理以及在细胞中起到的作用。蛋白质复合物的结构可以为蛋白质界面提供信息,可以协助进行药物设计。蛋白质对接可以帮助我们了解信号通路和评价复合物的亲和性。近年来预测蛋白质和蛋白质的相互作用成为了热点。然而,在预测技术上有两个难点仍然有待提高,一个是筛选/计分方法的效率,另一个是蛋白质柔韧性的处理。这两大难点的共同问题就是最终的蛋白质-蛋白质对接预测的准确性低。我们意在对这两个国际公认的难点进行有针对性的攻关,以期提高蛋白质-蛋白质对接预测的准确性。
2 淀粉样β蛋白聚集的抑制