拟然值是在基因组遗传作图中表示为特定观测表现型出现的可能性。英文:likelihood。最大似然,定义为以满足其估计值在观察结果中出现的概率最大为条件。
基本内容
简介
似然比 = L(r)/ L(1/2)
L(r):假设两个标记间以r的重组率相连锁的概率;
L(1/2):假设两个标记间为非连锁的概率。
Linkage test (连锁检验):
L(r)
LOD = log ------------
L(1/2)
LOD为L(r)/ L(1/2)取以10为底的对数。
在实际应用技术中,要求似然比L(r)/ L(1/2)大于1000:1,即LOD>3.0,才能证实这两标记间存在连锁。即
LOD = log L(r)/ L(1/2)
= log 1000
=3.0