日本唯一的综合性海洋研究所。所址东京都。成立于1962年4月1日。隶属文部省，从事海洋科学基础理论研究。首任所长为日高孝次教授。该所有海洋物理、海洋气象、海洋地球物理、海底沉积、洋底构造地质、海洋无机化学、海洋生物化学、海洋生物生理、海洋生物生态、浮游生物、海洋微生物、资源分析、资源生物、资源环境、 渔业测定等 15个研究室。拥有海洋调查船“白凤丸”和“淡青丸”；并设立了“大槌临海研究中心”，从事临海现场的海洋学实验、分析和研究。